Kartan syftar till att vara ett aktuellt underlag som beskriver den faktiska utbredningen av de naturtyper som ingår i Art- och habitatdirektivets bilaga 1 inom skyddade områden. Karteringen täcker till exempel Natura 2000 områden, naturreservat och nationalparker.
Natura Naturtypskartan används som ett av flera underlag för rapporteringen till EU. Den används också som underlag för skötsel, förvaltning och uppföljning inom skyddade områden, det är en den mest utförliga karteringen av Natura naturtypernas utbredning i skyddade områden som finns i Sverige. Natura Naturtypskartan ger en heltäckande kartering inom områdesskydd och inkluderar alla naturtypsgrupper och inte enbart skog, våtmark eller öppen mark. Karteringen sker främst i ortofoton med stöd av ett stort antal underlag i form av internationella och regionala karteringar, trädhöjdsraster, höjdmodellen, satellitbilder, jordartskartan, historiska ortofoton, artobservationer mm.
Natura Naturtypskartan har sin bas i fjärranalys och kan därmed täcka in stora arealer, ge en nationellt jämförbar kartering och en bra överblick av områden som kan vara svåråtkomliga med traditionella fältinventeringsmetoder.
